NATO sa neangažuje v ochrane flotily humanitárnej pomoci pre Gazu, hoci členské štáty NATO, konkrétne Taliansko a Španielsko, vyslali vojenské lode, aby sprevádzali plavidlá s pomocou. Konfrontácia flotily s Izraelom však riskuje eskaláciu napätia a potenciálne zhoršenie vzťahov Európskej únie.
Predstaviteľ NATO vo štvrtok 25. septembra prehlásil, že spojenci zostávajú hlboko znepokojení situáciou na Blízkom východe. Tento výrok odráža všeobecnú obavu z pretrvávajúcich konfliktov a nestability v regióne. Prítomnosť talianskych a španielskych vojnových lodí je motivovaná snahou zabezpečiť bezpečnosť a nerušený priebeh prepravy humanitárnej pomoci. Napriek tomu, zásah proti flotile, ktorý by viedol napríklad k zraneniam civilistov, môže mať vážne dôsledky pre diplomatické vzťahy a ešte prehĺbiť rozdiely v názoroch na riešenie izraelsko-palestínskeho konfliktu. Situácia je citlivá a vyžaduje si obozretný prístup všetkých zúčastnených strán.
